Структура інституту

• Керівництво
• Апарат управління
1. Відділ кадрів
2. Планово-економічний відділ
3. Бухгалтерія
• Науково-дослідницькі підрозділи
1. Відділення мікробіології
1. Лабораторія клінічної мікробіології
2. Лабораторія специфічної профілактики каплинних інфекцій
3. Лабораторія вірусних інфекцій
4. Лабораторія нових та маловивчених інфекційних захворювань
5. Лабораторія протимікробних засобів
6. Лабораторія екологічного та епідеміологічного моніторингу
7. Лабораторія біохімії мікроорганізмів та живильних середовищ
2. Відділення імунології
1. Лабораторія імунореабілітації
2. Лабораторія клінічної імунології та алергології
3. Лабораторія молекулярного моделювання
4. Клінічне імунологічене відділення
• Функціональні підрозділи
1. Відділ науково-медичної інформації та патентно-ліцензийної роботы
2. Відділ міжнародних зв'язків
3. Науково-медична бібліотека
4. Віварій
5. Музей патогенних для людини мікроорганізмів
• Додаткові підрозділи
1. Господарський відділ